Сергей Романович Черногубовский окончил Санкт-Петербургский государственный морской технический университет по специальности «инженер-кораблестроитель». Его трудовая деятельность началась на Адмиралтейских верфях в 1993 году.
За почти 30 лет трудового стажа Сергей Черногубовский занимал различные руководящие должности. Работая в структуре Госкорпорации «Росатом» – «Концерн Росэнергоатом», он возглавлял строительство единственной в мире плавучей атомной электростанции «Академик Ломоносов», затем в течении пяти лет руководил строительством головного и первых двух серийных универсальных атомных ледоколов проекта 22220 на Балтийском заводе. Также Сергей Черногубовский работал первым заместителем директора – заместителем директора по производству филиала «Севастопольский морской завод» АО «ЦС «Звездочка».
С 2021 года Сергей Черногубовский возглавлял Департамент гражданского судостроения Объединенной судостроительной корпорации, а в январе 2023 года был назначен на должность исполнительного директора ВСЗ.
